
A maior parte da investigação científica portuguesa é realizada em Unidades de I&D e Laboratórios Associados, financiadas e avaliadas pela FCT. Existem atualmente 293 Unidades de I&D e 26 Laboratórios Associados, onde trabalham mais de 12 000 investigadores.
A investigação realizada nestas instituições abarca todos os domínios científicos, desde as ciências da vida e da saúde às ciências sociais e humanas, passando pelas engenharias, ciências exatas, ciências naturais e do ambiente.
As instituições de I&D são regularmente avaliadas pela FCT, com uma periodicidade de aproximadamente 5 anos. Os processos de avaliação envolvem painéis internacionais de cientistas reconhecidos na sua área de investigação.